Segmentation basée sur un atlas statistique (application aux IRM de prostate)

Il s’agit d’utiliser une information a priori pour segmenter automatiquement des volumes 3D (ici des IRM). Sur la base d’un certain nombre de cas segmentés par un opérateur expert, un atlas est construit après recalage élastique des différents examens et de leurs segmentations. Cet atlas inclut l’image moyenne, les segmentations « projetées » dans cette image moyenne et un modèle statistique de la surface de la prostate. La segmentation d’un nouvel examen se fait par recalage de l’examen avec l’atlas. Ce recalage étant effectué, les informations de contours et de forme de la prostate sont utilisées pour segmenter ces nouvelles données. La base de l’approche est donc un recalage hybride (iconique et géométrique).

atlas

Publications:

S. Martin, V. Daanen, J. Troccaz. Automated Segmentation of the Prostate in 3D MR Images Using a  Probabilistic Atlas and a Spatially Constrained Deformable Model, Medical Physics, 2010, 37(4) :1579-1590 (pdf

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Thèse de Sébastien MARTIN soutenue en décembre 2008, accessible sur le serveur du CNRS (Thèses en ligne)

Collaborations : CHU de Grenoble (Dr Philippe Fourneret – Service de radiothérapie)

Financements : Allocation de recherche Région Rhône-Alpes (Cluster ISLE) – projet RNTS 2005 SMI – Pôle Maths-STIC UJF

Status : TERMINE

Evalué sur une base de données de 18 IRM endorectales puis sur une base de 36 cas d’IRM avec antenne abdominale. Dans les deux cas il s’agissait de patients souffrant d’un cancer de la prostate.

Outils de segmentation intégrés à l’Urostation de la société KOELIS.

Contact : jocelyne.troccaz@imag.fr